Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG7P62955 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms