Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL23P62829 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL23P62829 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL23P62829 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL23P62829 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms