Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms