Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms