Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms