Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCC3P46736 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms