Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms