Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJC1P36383 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJC1P36383 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJC1P36383 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJC1P36383 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJC1P36383 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJC1P36383 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJC1P36383 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJC1P36383 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJC1P36383 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms