Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCKARP32238 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms