Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms