Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XBP1P17861 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XBP1P17861 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XBP1P17861 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XBP1P17861 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XBP1P17861 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XBP1P17861 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XBP1P17861 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XBP1P17861 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XBP1P17861 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XBP1P17861 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XBP1P17861 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XBP1P17861 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XBP1P17861 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XBP1P17861 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XBP1P17861 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XBP1P17861 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XBP1P17861 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XBP1P17861 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XBP1P17861 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
XBP1P17861 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XBP1P17861 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XBP1P17861 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XBP1P17861 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XBP1P17861 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XBP1P17861 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XBP1P17861 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XBP1P17861 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XBP1P17861 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XBP1P17861 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XBP1P17861 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XBP1P17861 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XBP1P17861 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XBP1P17861 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XBP1P17861 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XBP1P17861 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XBP1P17861 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
XBP1P17861 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms