Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRF1P14222 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRF1P14222 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRF1P14222 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PRF1P14222 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRF1P14222 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRF1P14222 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRF1P14222 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRF1P14222 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms