Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP10AO60312 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP10AO60312 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms