Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BNIP3LO60238 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms