Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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