Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TRMT10B-201ENST00000297994 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 HOXA-AS2-201ENST00000517550 2022 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 HTR5A-AS1-201ENST00000395731 2703 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 DCAF11-202ENST00000396936 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 LY6G5B-208ENST00000409525 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 USP4-204ENST00000416417 1536 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ZNF19-205ENST00000564230 2205 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 LINC00951-201ENST00000373171 554 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SEC14L2-201ENST00000402592 1229 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AL392185.1-201ENST00000419620 395 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RAB15-202ENST00000426039 683 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ZNF776-202ENST00000431353 549 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC007163.1-201ENST00000447972 877 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RPSAP3-201ENST00000464073 887 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 LSP1P2-201ENST00000479042 133 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RN7SL801P-201ENST00000479462 302 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 CMSS1-205ENST00000489081 1056 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ZEB2P1-201ENST00000515048 1141 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC069120.3-201ENST00000519764 537 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ADM-204ENST00000526492 641 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 CCDC90B-211ENST00000529073 719 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 LINC02414-201ENST00000537280 494 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ZNF226-214ENST00000589160 656 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC079882.1-201ENST00000609433 375 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TMEM69-201ENST00000372025 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 C3orf14-206ENST00000494481 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RAPGEF3-201ENST00000389212 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PTPRJQ12913 TREM1-201ENST00000244709 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PTPRJQ12913 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 LINGO4-201ENST00000368820 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SLC8A3-201ENST00000216568 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TUBD1-201ENST00000325752 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SMARCE1-203ENST00000377808 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 UPK1B-201ENST00000264234 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 CHI3L2-202ENST00000369748 1468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 AC233724.12-201ENST00000512227 594 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 snoZ6.1-201ENST00000516391 75 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC015712.1-204ENST00000558254 755 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RAB11A-204ENST00000565075 711 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RN7SL491P-201ENST00000584748 269 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC016773.1-201ENST00000605571 802 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 MIR6511B1-201ENST00000612014 85 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SPECC1-204ENST00000395527 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ZNF195-215ENST00000526601 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC009159.4-201ENST00000624606 2031 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 BCAT1-205ENST00000539282 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 IMPDH2-201ENST00000326739 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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