Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms