Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPSEQ9Y251 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms