Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS2Q9Y248 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms