Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSKSQ9UJT2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms