Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms