Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms