Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms