Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00597Q9H2U6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms