Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms