Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms