Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms