Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms