Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIBP1Q86W92 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms