Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf46Q504U0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf46Q504U0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms