Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms