Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms