Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT31Q15323 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT31Q15323 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT31Q15323 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT31Q15323 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT31Q15323 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT31Q15323 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT31Q15323 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms