Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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