Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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