Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXL1Q08397 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms