Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG1Q06432 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG1Q06432 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms