Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms