Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms