Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BGRP55822 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms