Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELLP55199 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELLP55199 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELLP55199 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELLP55199 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELLP55199 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELLP55199 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELLP55199 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELLP55199 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELLP55199 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELLP55199 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELLP55199 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ELLP55199 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms