Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YARSP54577 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YARSP54577 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YARSP54577 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YARSP54577 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YARSP54577 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YARSP54577 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YARSP54577 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YARSP54577 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YARSP54577 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YARSP54577 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YARSP54577 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YARSP54577 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms