Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PGGT1BP53609 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PGGT1BP53609 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PGGT1BP53609 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PGGT1BP53609 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PGGT1BP53609 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PGGT1BP53609 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PGGT1BP53609 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PGGT1BP53609 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PGGT1BP53609 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PGGT1BP53609 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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