Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms