Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRR2P28476 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRR2P28476 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR2P28476 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms