Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms