Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CT47B1P0C2W7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms