Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NSD2O96028 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NSD2O96028 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NSD2O96028 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NSD2O96028 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NSD2O96028 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NSD2O96028 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NSD2O96028 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NSD2O96028 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NSD2O96028 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NSD2O96028 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NSD2O96028 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSD2O96028 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NSD2O96028 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NSD2O96028 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NSD2O96028 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NSD2O96028 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NSD2O96028 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NSD2O96028 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSD2O96028 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSD2O96028 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSD2O96028 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NSD2O96028 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms