Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR1AO95602 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
POLR1AO95602 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR1AO95602 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms