Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTXRO95502 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms